木瓜蛋白酶（  Papain  ）简称木瓜酶，又称为木瓜酵素。是利用未成熟的番木瓜（  Carica papaya  ）果实中的乳汁，采用现代生物工程技术提炼而成的生物酶制品。

其主要作用是对蛋白质有极强的加水分解能力。主要用于啤酒抗寒(水解啤酒中的蛋白质，避免冷藏后引起的浑浊)、肉类软化(水解肌肉蛋白和胶原蛋白，使肉类嫩化)、谷类预煮的准备、水解蛋白质的生产。在啤酒抗寒和肉类软化方面的应用，远比其他蛋白酶。木瓜蛋白酶可以降低面团湿筋度、改良面团可塑性及理化性质，同时使蛋白质大分子水解成短肽和氨基酸，从而有利于糖类和氨基类物质进行复杂的美拉德反应，使产品上色快，色泽悦目有油润光鲜感，疏松酥脆容比力大，断面网状结构明显，层次好；裂饼、碎饼率降低，饼形端正饱满不缩身，花纹清晰，饼面光滑。